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Carbon Emacs 上で ATOK 2008 for Mac を使う際に ctrl を Emacs に取られて使い辛いという皆様へ

(setq mac-pass-control-to-system t)

もし必要があればこちらも……。

(setq mac-pass-command-to-system t)

なおこれらは陽に nil にしないと t (な筈)ですので、.emacs から当該定義を削ってしまっても良いかと思います。
FYI: [emacs] View of /emacs/src/macterm.c

Emacs に ctrl を握らせた方が使い良い場面も多いのが悩みどころですが…… :)